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基于翻译控制上的“布尔门”研究

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基于翻译控制上的“布尔门”研究
论文目录
 
Abstract第1-7页
摘要第7-12页
Chapter 1 Introduction第12-24页
  1.1 Background and significance of this study第12-13页
  1.2 Latest development in Synthetic Biology第13-15页
  1.3 Biosensors and Boolean gates in synthetic biology第15-16页
  1.4 Boolean gates based on RNAi第16-17页
  1.5 Main and additional research content and goal第17-23页
  1.6 Technology roadmap第23-24页
Chapter 2 Experiment materials and methods第24-38页
  2.1 Laboratory equipments第24-25页
  2.2 Reagents and materials第25-26页
  2.3 Experimental methods第26-38页
    2.3.1 Colony picking第26-27页
    2.3.2 Mini preparation第27-28页
    2.3.3 Restriction digest第28页
    2.3.4 Gel electrophoresis第28-29页
    2.3.5 DNA elution第29-30页
    2.3.6 Gibson Assembly (One-step isothermal DNA assembly)第30-31页
    2.3.7 MoClo Assembly (For 0-module plasmids)第31-32页
    2.3.8 MoClo Assembly (For 1-module plasmids)第32-33页
    2.3.9 DNA ligation with T4 ligase第33-34页
    2.3.10 Bacterial transformation第34-35页
    2.3.11 Yeast transformation and integration第35-36页
    2.3.12 Yeast cells streaking and culture第36-37页
    2.3.13 DNA extraction from yeast cells第37-38页
Chapter 3 DNA assembly第38-48页
  3.1 Theory of Gibson method第38-41页
  3.2 Theory of MoClo method第41-46页
  3.3 Brief summary第46-48页
Chapter 4 Constructing Boolean gates based on translational controls第48-61页
  4.1 Construction of the target sequence that expresses fluorescence第48-49页
  4.2 Integration of the target sequence into yeast cells第49页
  4.3 Integration of the Dicer and the Argonaute in the yeast strain containing the target sequence (infrastructure for RNAi)第49-51页
  4.4 Engineering RNAi with the hairpin as a siRNA precursor第51-52页
  4.5 Engineering RNAi with convergent promoters第52-59页
    4.5.1 Convergent promoters design with pGPD第52-54页
    4.5.2 New convergent promoter design with pGAL1第54-55页
    4.5.3 Convergent promoter design with a single intron sequence第55-57页
    4.5.4 Two different transcription units (sense-antisense design) for siRNA precursor expression第57-59页
  4.6 Brief summary第59-61页
Conclusion第61-62页
References第62-67页
Acknowledgements第67页

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